우리나라 민물고기의 아름다움을 널리 알리고 자라나는 청소년 및 어린이들에게 살아있는 생태체험 학습의 장을 제공하기 위해 2006년 11월 8일에 개관했다. 민물고기 단일 테마로 구성된 국내 최대 규모로 개관한 생태체험관은 116종 2,630여 마리를 전시 운영 중이다. 또한 다양한 전시와 기획 운영으로 민물고기에 대한 흥미유발, 생명의 신비함과 과학적 탐구심을 고취시키고 생물자원에 대한 이해증진 및 사라져 가는 토종, 멸종위기어종 등 전시하여 동해안의 새로운 관광명소로 확고한 자리매김을 하였다. 특히 2008년 10월 국내최초의 생물자원보존시설로 등록(환경부지정)되었고, 2009년 12월 교육과학기술부지정 과학관 등록을 완료했으며 2015년 12월 수입·반입된 국제적 멸종위기어종 양수신고 및 사육시설 등록(환경부)을 완료, 2018년도에는 수족관 등록을 완료하여 생태교육용 학습시설로 활용도가 높다. 주요 전시 테마는 하천 유역별 서식어종 전시, 소중한 민물고기, 연어 고향관, 대형 민물고기 전시 등이 있으며 이를 통해 생물자원에 대한 이해 증진을 돕고 있다. 이 밖에도 민물고기생태체험관에서는 물고기에게 직접 먹이를 주는 경험을 할 수 있다. 1층 열대어 전시관 안쪽에 마련된 거대한 먹이 주기 체험장과 독도 모형 수조에서 물고기에게 먹이를 주고 직접 물고기를 만져볼 수 있다.

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